В 1722 году на территории города Астрахани возник речной порт с различными пристанями, принадлежащими частным компаниям и пароходствам, которые существовали до 1918 года.

С 1918 года все частные фирмы и компании сохранили свои организации, подчинив их избранному центральному Деловому Совету.

С 6 января 1919 весь речной транспорт и пристани были национализированы и переданы в ведение Астраханского районного управления.

В 1923 году районное управление реорганизовано в Волжское Государственное речное пароходство - ВГРП – с правлением в городе Горьком, а в Астрахани организовано товаро-пассажирское агентство, которое в 1929 году переименовано в сухогрузную пристань Нижне-Волжского речного пароходства.

С 1933 по 1948 год Астраханский местный флот НВРП.

С 1949 по 1954 год - Астраханское районное управление Волжского грузо-пассажирского речного пароходства.

Приказом 154 от 23 декабря 1954 года на базе Волжского грузового и Волжского грузо-пассажирского речных пароходств произошла организация Волжского объединенного речного пароходства. Этим же приказом в составе ВОРП были создано Сталинградское линейное пароходство, в который и вошел речной порт Астрахань.

С 1955 года по август 1958 года – Астраханская пассажирская пристань Сталинградского линейного пароходства.

На основании приказа номер 2 от 8 августа 1958 года Астраханское районное управление Сталинградского линейного пароходства объединить с Астраханским Р Э Б имени Артема (Сергеева) Сталинградского линейного пароходства, объединенное производство именовать – Астраханское районное управление Сталинградского линейного пароходства.

С 1961 года Астраханское районное управление Сталинградского линейного пароходства именовать Астраханское районное управление Волгоградского линейного пароходства. На основании приказа номер 83 от 12 августа 1960 года Астраханский речной порт Нижне-Волжского речного пароходства объединить с Астраханским Морторгагентством Каспийского рейдового пароходства, объединенный порт именовать Астраханский речной порт НВРП.

На основании приказа министра речного флота РСФСР номер 71 от 22 марта 1962 года Астраханское районное управление Волгоградского линейного пароходства объединено с Астраханским речным портом НВРП, объединенный порт именовать Астраханский порт Волжского объединенного пароходства.

В 1994 году Астраханский порт ВОРП преобразован в АООТ «Астраханский порт» согласно приказу 151 от 20 апреля 1994 года.

В 1998 году АООТ «Астраханский порт» преобразован в ОАО «Астраханский порт» согласно приказу генерального директора АООТ «Астраханский порт» номер 338 от 01 июля 1998 года.

В 2006 году с 1 апреля Ремонтно-эксплуатационный Район именовать «ПОРТОФЛОТ» согласно приказу генерального директора ОАО «Астраханский порт» номер 160 от 17 апреля 2006 года.

В 2014 году Открытое акционерное Общество «Астраханский порт» переименован в Публичное акционерное общество «Астраханский порт» (ПАО «Астраханский порт») согласно приказу генерального директора ПАО «Астраханский порт» номер 265 от 01 декабря 2014 года.